出口木质包装除害处理目前有两种方式：熏蒸处理（MB）,热处理（HT）。这两种处理方式和特点各不相同，熏蒸处理是药物处理，也称之为溴甲烷熏蒸处理，是一种高效杀虫灭菌的除害处理办法，但溴甲烷的沸点为3.6摄氏度，在气温低于6摄氏度时很难气化的，特别是在冬天温度低时对木质包装熏蒸处理必将碰到施药难得问题，同时也影响了熏蒸处理的有效性，而且熏蒸处理存在操作危险性，50米内禁止人畜进入。大气臭氧层破坏大，受天气变化影响较大，所以在发达国家提议限制直至终全面禁止溴甲烷熏蒸，从2003年限制并计划到2015年起停止使用溴甲烷。目前我国也慢慢由原来的熏蒸处理改为热处理。

 出口木质包装在经过热处理是在一定的温度和持续时间内，使用温热空气对木质包装或木质材料进行处理，以杀灭木质包装携带的有害生物。熏蒸处理对能否完全杀灭松材线虫一直存在争议，但热处理在升到一定温度能直接将所有有害生物包括松材线虫都杀光的，热处理木质包装出炉不开裂，不会过分变形。